Organ poslovođenja Fakulteta je dekan.
Dekan se bira iz reda redovnih profesora na Fakultetu koji su u radnom odnosu sa punim radnim vremenom.
Poseban uslov za izbor dekana je da ispunjava uslove za mentora, u skladu sa kriterijumima Nacionalnog saveta za visoko obrazovanje.
Dekan za svoj rad odgovara Savetu Fakulteta.
Dekan formira kolegijum koji čine prodekani i sekretar Fakulteta.
Rukovodstvo fakulteta
DEKAN
Prof. dr Vladimir Jakovljević 
Tel: +381 34 306 800 lokal101
(biografiju - Curriculum Vitae pogledajte ovde)
PRODEKAN za Integrisane akademske studije medicine
Prof. dr Dejan Petrović 
Tel: +381 306 800 lokal 121
(biografiju - Curriculum Vitae pogledajte ovde)
PRODEKAN za Integrisane akademske studije farmacije
Prof. dr Željko Mijailović 
Tel: +381 306 800 lokal 121
(biografiju - Curriculum Vitae pogledajte ovde)
PRODEKAN za Integrisane akademske studije stomatologije
Prof. dr Gvozden Rosić 
Tel: +381 34 306 800
(biografiju - Curriculum Vitae pogledajte ovde)
PRODEKAN za Osnovne strukovne studije
Prof. dr Nataša Zdravković 
Tel: +381 306 800
(biografiju - Curriculum Vitae pogledajte ovde)
PRODEKAN za Doktorske akademske studije - medicinske nauke
Prof. dr Ivan Srejović 
Tel: +381 34 306 800
(biografiju - Curriculum Vitae pogledajte ovde)
PRODEKAN za Master studije
Prof. dr Nebojša Zdravković 
Tel: +381 34 306 800
(biografiju - Curriculum Vitae pogledajte ovde)
PRODEKAN za Univerzitetske studijske programe
Prof. dr Vladimir Janjić 
Tel: +381 34 306 800
(biografiju - Curriculum Vitae pogledajte ovde)
PRODEKAN za akreditaciju i reformu nastave
Prof. dr Marko Folić 
Tel: +381 34 306 800
(biografiju - Curriculum Vitae pogledajte ovde)
PRODEKAN specijalističkih i uže specijalističkih studija
Prof. dr Goran Davidović 
Tel: +381 306 800 lokal 103
(biografiju - Curriculum Vitae pogledajte ovde)
PRODEKAN za zdravstvenu delatnost
Prof. dr Mirjana Veselinović 
(biografiju - Curriculum Vitae pogledajte ovde)
PRODEKAN za međunarodnu saradnju i naučno-istraživački rad
Prof. dr Nevena Jeremić 
Tel: +381 34 306 800 lokal 104
(biografiju - Curriculum Vitae pogledajte ovde)
PRODEKAN za Kontinuiranu medicinsku edukaciju
Prof. dr Dušan Đurić 
Tel: +381 34 306 800
(biografiju - Curriculum Vitae pogledajte ovde)
SEKRETAR fakulteta
Snežana Ivezić, dipl. pravnik 
Tel: +381 306 800 lokal 107