Page 987 - 59. КОНГРЕС СТУДЕНАТА БИОМЕДИЦИНСКИХ НАУКА СРБИЈЕ СА ИНТЕРНАЦИОНАЛНИМ УЧЕШЋЕМ
P. 987
59. КОНГРЕС СТУДЕНАТА БИОМЕДИЦИНСКИХ НАУКА СРБИЈЕ 26-30.
СА ИНТЕРНАЦИОНАЛНИМ УЧЕШЋЕМ Април
КАРАКТЕРИЗАЦИЈА ВЕЗИВНИХ МЕСТА ЖУЧНИХ КИСЕЛИНА НА РЕЦЕПТОРИМА КОЈИ ПОСРЕДУЈУ У ЊИХОВОЈ ТОКСИЧНОСТИ
– ДОКИНГ СТУДИЈА
Аутор: Исидора Купрешак
e-mail: kupresakisidora@gmail.com
Ментор: Истр. припр. др Стоја Обрадовић
Катедра за фармацију, Медицински факултет Универзитет у Новом Саду
Увод: Жучне киселине су регулатори бројних метаболичких путева зато што могу да модификују активност одређених
нуклеарних рецептора. У овом истраживању проучаване су интеракције између жучних киселина и нуклеарних рецептора
LXR, FXR, PXR и VDR. Структурна анализа комплекса рецептор-лиганд је неопходна за одређивање везивног места жучних
киселина на изабраним протеинима и структурних карактеристика лиганда.
Циљ рада: Циљ овог истраживања је дефинисање везивних места жучних киселина на изабраним рецепторима и
предвиђање њиховог појединачног потенцијала за интеракције са овим рецепторима.
Материјал и методе: Рецептори су анализирани коришћењем in-silico методе молекуларног докинга. Симулације су
спроведене са молекулима 19 жучних киселина, атровастатину, калцитролу, GW3965, Т0901317, кетоконазолу и
обетиохолној киселини као као лигандима.
Резултати: Докинг симулације су показале да се све анализиране жучне киселине везују за исто везивно место на VDR. На
LXRα могу се разликовати два везивна места за жучне киселине. Лиганди показују већи афинитет за друго везивно место на
LXRα. Све жучне киселине осим α хиохолне киселине и α хенодеоксихолне киселине се везују за исто везивно место на FXR.
Жучне киселине из α серије показују мањи афинитет за FXR. Све жучне киселине као и атровастатин и кетоконазол се везују
за исто јединствено место за PXR.
Закључак: Резултати докинг симулација указују на могућност постојања компетитивног антагонизма између различитих
жучних киселина и анализираних лекова на одабраним рецепторима.
Кључне речи: молекуларни докинг; жучне киселине; нуклеарни рецептори; интеракције
CHARACTERIZATION OF BILE ACIDS BINDING SITES ON RECEPTORS WHICH MEDIATE IN THEIR TOXICITY- DOCKING STUDY
Author: Isidora Kuprešak
e-mail: kupresakisidora@gmail.com
Mentor: RT Stoja Obradović
Department of Pharmacy, Faculty of Medicine University of Novi Sad
Introduction: Bile acids are regulators of numerous metabolic pathways since they can modify the activity of certain nuclear
receptors. In this research the interactions between bile acids and nuclear receptors LXR, FXR, PXR and VDR were studied.
Structural analysis of receptor-ligand complexes is necessary for determination of bile acid binding site on selected proteins and of
structural characteristics of ligands.
The Aim: The purpose of this research is to define the binding spots of bile acids on chosen receptors and to predict their individual
potential for interactions with those receptors.
Material and Methods: The receptors have been analyzed using in-silico method of molecular docking. Simulations were conducted
on 19 bile acids, atorvastatin, calcitrol, GW3965, T0901317, ketoconazole and obeticholic acid as ligand molecules.
Results: Docking simulations have shown that analyzed bile acids bind to the same binding spot on the VDR. Two bile acid binding
spots on LXRα can be distinguished. The ligands show higher binding affinity for the second binding pocket on LXRα. All bile acids,
aside from α hyocholic acid and xenodochial acid bind to the same binding pocket on FXR. The bile acids from α series show lower
affinity for FXR. All bile acids, as well as atrovastatin and ketoconazole, bind to the same spot on PXR.
Conclusion: Results of docking simulations point to the conclusion that competitive antagonism between different bile acids and
selected drugs is possible for all analyzed receptors.
Keywords: molecular docking; bile acids; nuclear receptors; interaction
Kopaonik, 2018.
981