Page 236 - 59. КОНГРЕС СТУДЕНАТА БИОМЕДИЦИНСКИХ НАУКА СРБИЈЕ СА ИНТЕРНАЦИОНАЛНИМ УЧЕШЋЕМ

59th SERBIAN STUDENTS’ CONFERENCE OF BIOMEDICAL SCIENCES
April WITH INTERNATIONAL PARTICIPATION
26-30
ПРОЦЕНА ТРАЈАЊА ИНФЕКЦИЈЕ ВИРУСОМ ХУМАНЕ ИМУНОДЕФИЦИЈЕНЦИЈЕ КОД ПАЦИЈЕНАТА СА
НОВОДИЈАГНОСТИКОВАНОМ ИНФЕКЦИЈОМ

Аутор: Марија Рађеновић
e-mail: radjenovicmarija95@gmail.com
Ментор: проф. др Маја Станојевић
Институт за микробиологију и имунологију, Медицински факултет Универзитета у Београду.

Увод: Јавно-здравствени значај инфекције вирусом хумане имунодефицијенције (HIV) је још увек веома велики, с обзиром
да број особа које живе са HIV инфекцијом и даље расте. Методе за процену трајања инфекције вирусом хумане
имунодефицијенције код пацијената са новодијагностикованом инфекцијом имају веома велики значај како за лечење
пацијената тако и за увид у инциденцију инфекције.
Циљ рада: Процена дужине трајања инфекције код пацијената са новодијагностикованом HIV инфекцијом у Србији у два
временска периода, методом анализе заступљености истовремене појаве различитих база на истој позицији у геному
вируса (енгл.„ambiguity“ база), као и анализа учесталости трансмисије мутација резистенције у испитиваној популацији и
њене повезаности са дужином трајања инфекције.
Материјал и методе: У испитивање је укључено 36 пацијента, праћених на Одељењу за HIV/AIDS Клинике за инфективне и
тропске болести КСЦ, од којих је половина пацијената дијагностиковано 2002.године а друга половина 2016.године. Низом
поступака изолације, пречишћавања и PCR умножавања добијени су PCR продукти дела pol гена, који су затим обрађени
DNK секвенцирањем. Након слагања добијених секвенци у SeqScapeпрограму, за прецизну анализу процената „ambiguity“
база коришћен је Viruses.exe програм, развијен у оквиру овог истраживања.
Резултати: Укупан број пацијената са процењеном дужином трајања инфекције мањом од годину дана (заступљеност
секвенци са процентом ambiguity база <0,47%) био 17/36 (47,2%). Од 18 пацијената из 2016.године, 11 пацијената је било
инфицирано краће од годину дана (61,1%), док их је у 2002.години било 6/18 (33,3%). Присуство мутација примарне
резистенције показано је у укупно 3/36 узорака (8,3%).
Закуљчак: Добијени резултати показују пораст заступљености пацијената са новодијагностикованом HIV инфекцијом у
ранијој фази болести у 2016.години у односу на 2002.годину, уз одржање нивоа примарне резистенције, слично
трендовима у Европи.
Кључне речи: HIV; pol; дужина инфекције;„ ambiguity“база“

ASSESSMENT OF DURATION OF HUMAN IMUNODEFICIENCY VIRUS INFECTION IN NEWLY DIAGNOSED PATIENTS

Author: Marija Rađenović
e-mail: radjenovicmarija95@gmail.com
Mentor: Assoc. Prof.Maja Stanojević,
Institute for microbiology and imunology, Faculty of Medicine University of Belgrade.

Introduction: Public health significance of HIV infection remains to be very high, given that the number of people living with HIV
continues to grow. Methods for estimating the duration of HIV infection in patients with newly diagnosed infection are very
important, both for individual patient’s treatment and for an insight into the incidence of infection at the population level.
The Aim: To estimate the duration of infection in patients with newly diagnosed HIV infection in Serbia in two time periods, by
analyzing the occurrence of ambiguous bases in HIV pol sequences, and to analyze the prevalence of transmitted drug resistance.
Material and Methods: The study involved 36 patients. Half of the studies patients had been diagnosed in 2002 and half in 2016.
Isolation, purification and PCR amplification of the obtained PCR products of the pol gene were applied, and followed by DNA
sequencing. The resulting sequences were arranged in the SeqScapepograme, and for the precise analysis of the percentage of
"ambiguity" bases, the Viruses.exe program was used.
Results: Total number of patients with estimated duration of infection of less then 1 year (based on the percentage of ambiguous
basecalls<0.47%) was found to be 17/36 (47.2%). Out of 18 patients from 2016, 11 patients were infected for shorter than one
year, while the remaining 7 patients were infected for more than a year. The situation in 2002 is different, in favor of the infected
for more than a year, which was 12, versus 6 patients who have been carrying the virus for less than a year.
Conclusion: The obtained results show an increase in the prevalence of patients with newly diagnosed HIV infection in the early
stage of disease in 2016 compared to 2002, with the maintenance of primary resistance level.
Keywords: HIV; pol; length of infection; “ambiguous bases”

Kopaonik, 2018.
230