Page 1002 - 59. КОНГРЕС СТУДЕНАТА БИОМЕДИЦИНСКИХ НАУКА СРБИЈЕ СА ИНТЕРНАЦИОНАЛНИМ УЧЕШЋЕМ

59th SERBIAN STUDENTS’ CONFERENCE OF BIOMEDICAL SCIENCES
April WITH INTERNATIONAL PARTICIPATION
26-30
МОЛЕКУЛСКО МОДЕЛОВАЊЕ, 3D-QSAR СТУДИЈА И АНАЛИЗА СТРУКТУРЕ ФАРМАКОФОРЕ ИНХИБИТОРА КИНАЗЕ PI3K-α

Аутор: Милан Јовановић
e-mail: milan.jov94@gmail.com
Ментор: проф. др Катарина Николић, маг. фарм. Жарко Гагић
Катедра за фармацеутску хемију, Фармацеутски факултет Универзитета у Београду

Увод: PI3K-α, као ензим са повећаном активношћу у многим типовима канцера, представља важно циљно место дејства за
испитивање нових цитостатика.
Циљ рада: Формирање 3D-QSAR модела и 3D-структуре фармакофоре инхибитора PI3K-α, валидација формираног 3D-QSAR
модела и дефинисање смерница за дизајн нових инхибитора PI3K-α.
Материјал и методе: Студија је примењена на data set-у од који су хомогено распоређени у интервалу активности на
training set од 62 једињења и test set од 30 једињења. Training set је коришћен за формирање 3D-QSAR модела, а test set за
валидацију изабраног модела. Модел је формиран у Pentacle 1,07 програму.
2
2
2
Резултати: Израчунати валидациони параметри за training set (R =0,84; Q =0,67; SDEP=0,442) i за test set (R pred =0,681 и
SDEP=0,567) указују на поузданост и добру моћ предвиђања модела. Анализом фармакофора је показано да највећи
позитиван утицај на активност има присуство донора и акцептора водоничне везе на међусобном растојању од 18 до 18,4Å
(Var 647: O-N1), присуство донора и акцептора водоничне везе на међусобном растојању од 12 до 12,4Å (Var 632: O-N1),
постојање хидрофобног центра и донора водоничне везе на растојању од 15,2 до 15,6Å (Var 382: DRY-O), постојање
структуре адекватних стерних карактеристика и донора водоничне везе на растојању од 1,6 до 2Å (Var 692: O-TIP) и
присуство акцептора водоничне везе и стерног центра на растојању од 14,4 до 14,8Å (Var 810: N1-TIP).
Закључак: Формиран је 3D-QSAR модел који може да се користи за даља испитивања.
Кључне речи: 3D-QSAR; инхибитори PI3K-α киназе; структура фармакофоре

MOLECULAR MODELING, 3D-QSAR STUDIES AND ANALYSIS OF THE STRUCTURE OF THE FARMACOPHORE OF THE PI3K-Α KINASE
INHIBITORS

Author: Milan Jovanović
e-mail: milan.jov94@gmail.com
Mentor: Assoc. Prof. Katarina Nikolic, Mr. Pharm. Zarko Gagic
Department of Pharmaceutical Chemistry, Faculty of Pharmacy University of Belgrade

Introduction: PI3K-α, as an enzyme, with increased activity in many types of cancer represents important target for new cytostatic
agents research.
The Aim: Formation of 3D-QSAR models and 3D-structure of pharmacophore of PI3K-α inhibitors, validation of formed 3D-QSAR
models, and defining guidelines for the design of new PI3K-α inhibitors.
Material and Methods: The study was applied on data set containing 92 compounds homogeneously divided into training set,
composed of 62 compounds, and test set containing 30 compounds. Training set was used for building 3D-QSAR model, while test
set was used for model validation. Formation of model was performed by the use of Pentacle 1.07 program.
2
2
2
Results: Obtained validation parameters for training set are R =0.84; Q =0.67 и SDEP=0.442, and for test set R pred =0.681 и
SDEP=0.567 which indicate on reliability and good predictive potential of the 3D-QSAR model. By analyzing pharmacophores it has
been determined that presence of hydrogen bond donor and hydrogen bond acceptor at a distance of 18 - 18.4Å (Var 647: O-N1),
presence of hydrogen bond donor and hydrogen bond acceptor at a distance of 12 – 12.4Å (Var 632: O-N1), presence of
hydrophobic domain and hydrogen bond donor at a distance of 15.2 – 15.6Å (Var 382: DRY-O), presence of steric hot spot and
hydrogen bond donor at a distance of 1.6 - 2Å (Var 692: O-TIP) and presence of hydrogen bond acceptor and steric hot spot at a
distance of 14.4 – 14.8Å (Var 810: N1-TIP) are most important for activity of PI3K-α inhibitors
Conclusion: 3D-QSAR model has been formed which can be used for further research.
Keywords: 3D-QSAR; PI3K-α kinase inhibitors; structure of pharmacophore

Kopaonik, 2018.
996