Page 248 - 59. КОНГРЕС СТУДЕНАТА БИОМЕДИЦИНСКИХ НАУКА СРБИЈЕ СА ИНТЕРНАЦИОНАЛНИМ УЧЕШЋЕМ

59th SERBIAN STUDENTS’ CONFERENCE OF BIOMEDICAL SCIENCES
April WITH INTERNATIONAL PARTICIPATION
26-30
УЧЕСТАЛОСТ МУТАЦИЈА У VP1 РЕГИОНУ БК POLYOMAVIRUS-a КОД ПАЦИЈЕНАТА СА ТРАНСПЛАНТИРАНИМ БУБРЕГОМ

Аутор: Теодора Карановић, Невена Косановић
e-mail: teodora.karanovic@gmail.com
Ментор: асист. др Данијела Каралић
Институт за микробиологију и имунологију, Медицински факултет Универзитета у Београду

Увод: Због употребе имуносупресивне терапије, код пацијената са трансплантираним бубрегом, реактивација БК
полиомавируса (BKPyV) може довести до настанка животно угрожавајућих обољења. Томе могу допринети нуклеотидне
измене у вирусном геному, вирусном капсидном протеину 1 (VP1) и његовим рецепторским доменима, доводећи до
настанка вирулентнијих сојева БК вируса.
Циљ рада: Циљеви овог рада били су да се одреди преваленција BKPyV виремије и вирурије, дистрибуција BKPyV субтипова
у узорцима, као и идентификација нуклеотидних измена у VP1 гену и аминокиселина у VP1 протеину БK вируса код
пацијената са трансплантираним бубрегом.
Материјал и методе:У студију су укључени узорци урина и крви 26 пацијената са трансплантираним бубрегом. Semi-nested
PCR методом су умножени фрагменти дужине 290-нт у оквируVP1 гена, а сви позитивни PCR продукти су затим директно
секвенцирани. Употребом одговарајућих биоинформатичких алата вршена је анализа секвенци.
Резултати: Укупна учесталост БK вирусне ДНK у крви износила је 30,8%, а у урину 38,5%. Међу пацијентима са
трансплантираним бубрегом са позитивним налазом BKPyV ДНK и у крви и у урину откривена су два субтипа вируса - I и IV.
Доминантан је био субтипI. Несинонимне нуклеотидне измене откривене су у BC рецепторском домену и β-плочи у оквиру
VP1 гена БK вируса. Статистички значајна разлика је утврђена у дистрибуцији мутација у оквиру BC рецепторског домена и
β-плоче међу изолатима БK вируса у крви (p=0,012). Број несинонимних нуклеотидних измена већи је код изолата нађених у
узорцима крви него у узорцима урина, али без статистичке значајности (p=0,231). Варијабилност вируса у крви већа је него у
урину.
Закључак: Чешће мутације у BC рецепторском домену VP1 региона могу довести до измене тропизма и стварања
агресивнијих варијанти BKPyV. Даља истраживања су потребна у овом смеру, у циљу идентификације пацијената са
трансплантираним бубрегом са већим ризиком за настанак обољења удружених са реактивацијом БK вируса.
Кључне речи: БK вирус; мутације;VP1; трансплантација бубрега; имуносупресија

THE PREVALENCE OF MUTATIONS IN VP1 GENE OF BK POLYOMAVIRUS IN RENAL TRANSPLANT RECIPIENTS

Author: Teodora Karanović, NevenaKosanović
e-mail: teodora.karanovic@gmail.com
Mentor: TA DanijelaKaralić
Institute of Microbiology and Immunology, Faculty od Medicine University of Belgrade

Introduction: Immunosuppressive therapy is a very important factor for reactivation of BK polyomavirus (BKPyV) in renal transplant
recipients (RTR). Reactivation of BKPyV in immunocompromised patients can cause life-threatening diseases such as polyomavirus-
associated nephropathy. Mutations in the VP1 gene and its BC loop may lead to the selection of more aggressive variants of BKPyV.
The Aim: The aims of this study were to determine the prevalence of BKPyV DNA in blood and urine samples, distribution of BKPyV
subtypes, and identification of nucleotide substitutions in VP1 gene and amino acids in BKPyV VP1 of RTR.
Material and Methods: The study included blood and urine samples of 26 RTR. Semi-nested PCR was used for amplification of 290-
nt fragment within the VP1 gene and all positive PCR products were directly sequenced. Sequence analysis was performed by using
appropriate bioinformatic tools.
Results: The frequency of BK viremia in RTR was 30.8% and viruria was 38.5%. Two subtypes of BK virus - I and IV, were detected
among RTR in both blood and urine samples. The predominant BKV subtype was I. The non-synonymous nucleotide substitutions
were detected in BC loop and β-sheets within the VP1 gene of BK virus. Statistically significant difference was found in the
distribution of mutations within the BC loop and β-sheet among the BK virus isolates from the blood (p=0.012). The number of non-
synonymous nucleotide substitutions was higher in isolates found in blood than in urine samples, but without statistical significance
(p=0.231).
Conclusion: Frequent mutations in the BC loop of the VP1 region can cause a change in tropism and the selection of more
aggressive variants of BKPyV. Further studies are needed in order to select the RTR with a higher risk for development of
polyomavirus associated-diseases.
Keywords: BK virus;mutations; VP1; renal transplantation; immunosuppression

Kopaonik, 2018.
242